На своем официальном сайте компания Apple сообщила о том, что при работе нового MacBook Air может возникать ряд проблем. Если к закрытому ноутбуку подключен внешний монитор, в некоторых случаях может происходить снижение пропускной способности беспроводной сети, которая использует полосу с частотой 2.4ГГц. Другая проблема заключается в низкой скорости подключения при подсоединении нескольких устройств Bluetooth. Кроме того, некоторые роутеры не работают с Remote Disc.
Самая большая проблема заключается в том, что желающим установить на свои MacBook Air Boot Camp и Windows необходим внешний CD привод для установки Windows, поскольку они не устанвавливаются через Remote Disc.
Наконец, с ноутбуком не совместимы некоторые модели наушников, из-за чрезмерной "утопленности" разъема в корпусе.